מנועי החיפוש הגדולים סופרים את כמות הלינקים הנכנסים כהצבעות המראות על איכות האתר. בראש ובראשונה מנועי החיפוש מעוניינים לראות ולספור לינקים טבעיים אשר מתווספים לאתר בצורה טבעית ולא על ידי החלפת קישורים או קניית קישורים ממומנים.
ישנם אינדקסים המציעים הכללה באינדקס בתמורה לתשלום סמלי כלשהו, לעיתים קישורים אלה נספרים בדומה לקישורים טבעיים מכיוון שההכללה היא מתבצעת בצורה אנושית ולא בעזרת חוות קישורים המכילות קישורים מכל הבא ליד. סביר להניח שמנועי החיפוש ובראש גוגל עושים זאת בעזרת שימוש באלגוריתמים הדומים באופן פעולתם לאלגוריתם TrustRanK.