קישורים פנימיים הם קישורים אשר מצביעים על עמודים פנימיים באתר.
אתרים המכילים מידע רב ומקודמים על פני מספר רב של ביטויי מפתח מכילים בדרך כלל, מספר עמודי תוכן רבים כאשר כל עמוד תוכן ממוקד בביטוי מפתח שונה. במהלך ביצוע בניית קישורים נכנסים לאתר, מקדמי אתרים מחלקים את הקישורים בין העמודים כך שכל ביטוי מפתח יקודם ולא רק ביטויי המפתח אשר משולבים בעמוד הראשי.